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生物质碳源随着污水脱氮要求的提高，新兴起专业生产碳源的企业，他们通过生物工程原理，对一些糖类、农产品废料等进行发酵，生产无害的生物制品，主要组分是小分子有机酸、醇类、糖类。其较单一的化学品更容易被微生物利用，其使用成本比单一化学品便宜，具备极高的性价比。
但其弊端：
产品的稳定性待提高，使用前需对每批次产品当量COD进行检测。
污泥水解上清液
生物转化挥发酸VFA 来源于污泥水解的上清液，由于水解所产生的 VFA 拥有很高的反硝化速率，碳源可以直接由污水厂内部提供，在污泥减容的同时还减少了碳源运输方面的问题，所以它是目前比较有优势的碳源。
生物复合碳源对于污泥水解利用做外碳源的研究，目前不同的结论有很多，但总体认为它作为反硝化脱氮系统的碳源是一种很有价值的方法。
复合碳生物脱氮需要完成硝化和反硝化两个过程。废水中的氨氮首先必须被硝化或转化成亚硝酸盐和硝酸盐，然后在反硝化过程中，硝酸盐被作为细胞呼吸过程中氧化简单碳化合物的供养体被还原成氮气。因此，以去除硝酸盐为目标的反硝化过程必须要有易生物降解的碳源存在。其来源包括进水中溶解性BOD、内源反硝化过程中细胞的糜烂物和各类上清液回流等。当进水溶解性有机物不足而脱氮要求很高时，则需要通过补充化学物质以提供反硝化过程所需要的碳源。该复合碳源药剂，为黑褐色液体，PH(1％水溶液)3.0-5.0，适用于城市污水以及工业废水，补充污水中碳源，调节微生物菌种脱氮所需营养比例。
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复合碳源性能与对比
醋酸钠
在污水中加入醋酸钠作为碳源, 通过实验发现, 碳氨比在 4-6 时, 可以达到稳定的脱氮效果, 而且它的水解物为小分子有机物, 能容易被微生物降解, 反硝化响应时间快, 而且, 能作为应急碳源。但是, 它价格较贵, 产泥率高, 对污水厂的污泥处置会带来了一定的压力。
葡萄糖
葡萄糖的理想碳氨比在 6. 4-7. 5, 比甲醇大得多, 而且它是多分子有机物, 不易被微生物所利用, 容易导致出水中 COD 的上升, 同时与甲醇、酒精相比, 葡萄糖更易出现亚硝态氮的累积, 因此, 不建议大量使用葡萄糖作为碳源。
